Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PCH4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PCH4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PCH4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
E9PCH4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
E9PCH4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
E9PCH4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
E9PCH4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
E9PCH4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PCH4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms