Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms