Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP17L12C9JPN9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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