Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms