Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B4DXG7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
B4DXG7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DXG7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms