Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WASHC1A8K0Z3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
WASHC1A8K0Z3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms