Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOBPA7XYQ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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