Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB13A6NJU9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms