Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TVP23AA6NH52 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TVP23AA6NH52 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms