Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MEIS3P1A6NDR6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms