Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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