Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
A4D1N5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
A4D1N5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
A4D1N5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms