Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGEF2Q9Y6D5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms