Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP16Q9Y5T5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms