Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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