Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms