Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms