Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms