Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHORDC1Q9UHD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms