Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms