Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms