Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms