Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms