Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms