Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf109Q9NX04 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms