Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms