Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms