Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPHK2Q9NRA0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms