Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms