Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms