Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCOLN1Q9GZU1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms