Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms