Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZCCHC2Q9C0B9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms