Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP74Q9C0B2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP74Q9C0B2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms