Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT23Q9C075 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT23Q9C075 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms