Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCGF6Q9BYE7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms