Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP4Q9BWG4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms