Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP8Q9BV40 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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