Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM79Q9BSE2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms