Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UTP23Q9BRU9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UTP23Q9BRU9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms