Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3CQ99985 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3CQ99985 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms