Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms