Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms