Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIT2Q99578 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIT2Q99578 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms