Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSF3RQ99062 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms