Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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