Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHIPQ96QV1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms