Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PLIN4Q96Q06 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLIN4Q96Q06 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms