Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC9Q96Q05 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms