Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85AQ96PX6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms